Tomáš Kubálek je docentem na MÚVS ČVUT, kde učí předměty zabývající se aplikací kancelářských programů.

Na VŠE v Praze byl řešitelem rozvojových projektů např. na zavedení evropského systému transferových kreditů (ECTS), distanční formy výuky, vícedruhových záznamů výuky, Office 365 či vzdělávání zaměstnanců.

Podílel se na projektu vybavení Rajské budovy VŠE mobiliářem, audiovizuální technikou a informačním systémem.

V letech 1994 - 2006 působil ve funkci proděkana pro pedagogiku a informatizaci Fakulty podnikohospodářské VŠE v Praze.

V letech 2008 - 2019 byl systémovým integrátorem Fakulty mezinárodních vztahů VŠE v Praze.

Je organizačním garantem programu Manažer obchodu v kombinované formě studia na VŠE.

Od roku 2016 je akademickým ředitelem a systémovým integrátorem Univerzity třetího věku VŠE v Praze.

Je testerem ECDL.

Předměty Manažerská informatika učí od roku 1990.

Spravuje blog o novinkách Microsoft Teams a Microsoft 365.